Databáze rostlin upravených editací genomu

29.11.2018 |

Vývoj v oblasti nových šlechtitelských technik je velmi rychlý. Již začíná být obtížné se orientovat v množství rostlin vzniklých právě těmito metodami. Vědci z Boyce Thompson Institute z New Yorku proto vytvořili platformu, kde bude snadné sledovat nebo vyhledat rostliny, které byly vytvořeny za pomocí techniky editace genomu. Celý projekt je financovaný National Science Foundation.

V databázi lze hledat podle druhu rostliny, podle genů, které nesou mutaci, nebo podle specifických genových identifikátorů (např. Solyc05g053230). Následně naleznete název rostiny, DNA konstrukt zahrnující RNA sekvenci a primery, které popisují výslednou mutaci, podrobnosti o pozměněné rostlinné linii, zda se jedná o heterozygoty či homozygoty a fenotyp, který byl pozorován.

Závěrem autoři databáze vyzývají uživatele ke sdílení dalších dat v oblasti rostlin, které byly upraveny editací genomu. Na webových stránkách jsou uvedeny přesné pokyny pro vložení těchto informací.

Prozatím databáze obsahuje rozsáhlé informace pouze o rajčatech vytvořených editací genomu s pomocí techniky CRISPR. Do databáze přejdete ZDE.

Zdroj:

http://plantcrispr.org/cgi-bin/crispr/index.cgi

http://www.isaaa.org/kc/cropbiotechupdate/article/default.asp?ID=17000